Status der Verfügbarkeit und Anwendung von „next generation sequencing“ (NGS) beim Harnblasenkarzinom – eine Umfrage in der Arbeitsgemeinschaft Uropathologie
Ortiz-Brüchle N, Muders M, Toma M, Esposito I, Hartmann A, Stöhr R, Reis H, Wild P, Köllermann J, Bremmer F, Leichsenring J, Stenzinger A, Merkelbach-Bruse S, Kirfel S, Perner S, Hartmann N, Roth W, Jung A, Kirchner T, Schwamborn K, Pfarr N, Dahl E, Knüchel R, Gaisa NT (2019)
Publication Type: Journal article
Publication year: 2019
Journal
DOI: 10.1007/s00120-019-01046-2
Abstract
Background: Technical advancement and availability of high-throughput analysis has advanced molecular subtyping of most cancers. Thus, new possibilities for precision oncology have emerged. Aim: Therefore, we aimed to collect data regarding availability and use of next generation sequencing (NGS) for urothelial cancer within the uropathology working group of the German Society of Pathology. Methods: We collected data by questionnaires and additionally asked for sequencing results of bladder cancers in the participating institutions. Results: A total of 13 university-affiliated institutes of pathology took part in the survey. All university institutes offer NGS-based molecular panel diagnostics and provide panels covering between 15 and 170 genes. Altogether, only 20 bladder cancers were sequenced in routine diagnostics and for 10 cancers potential targeted treatment options were available. Discussion: So far, despite availability of NGS diagnostics at university institutes of pathology, only few bladder cancer samples have been sequenced. Based on current data from the molecular subtyping of bladder cancers, we recommend a step-by-step protocol with basic immunohistochemistry analysis and subsequent subtype-dependent analyses, e.g., alterations of the fibroblast growth factor receptors (FGFR) or comprehensive gene panel analyses.
Authors with CRIS profile
Arndt Hartmann
Lehrstuhl für Allgemeine Pathologie und Pathologische Anatomie
Robert Stöhr
Lehrstuhl für Allgemeine Pathologie und Pathologische Anatomie
Involved external institutions
Rheinisch-Westfälische Technische Hochschule (RWTH) Aachen
Germany (DE)
Universitätsmedizin der Johannes Gutenberg-Universität Mainz
Germany (DE)
Ludwig-Maximilians-Universität (LMU)
Germany (DE)
Technische Universität München (TUM)
Germany (DE)
Universitätsklinikum Heidelberg
Germany (DE)
Dr. Senckenbergisches Institut für Pathologie
Germany (DE)
Universitätsklinikum Schleswig-Holstein (UKSH)
Germany (DE)
Universitätsklinikum Bonn
Germany (DE)
Universitätsklinikum Göttingen
Germany (DE)
Universitätsklinikum Düsseldorf
Germany (DE)
Universitätsklinikum Essen
Germany (DE)
Universitätsklinikum Köln
Germany (DE)
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Universitätsmedizin der Johannes Gutenberg-Universität Mainz
Germany (DE)
Ludwig-Maximilians-Universität (LMU)
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Technische Universität München (TUM)
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Universitätsklinikum Heidelberg
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Dr. Senckenbergisches Institut für Pathologie
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Universitätsklinikum Schleswig-Holstein (UKSH)
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Universitätsklinikum Bonn
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Universitätsklinikum Göttingen
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Universitätsklinikum Düsseldorf
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Universitätsklinikum Essen
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Universitätsklinikum Köln
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How to cite
APA:
Ortiz-Brüchle, N., Muders, M., Toma, M., Esposito, I., Hartmann, A., Stöhr, R.,... Gaisa, N.T. (2019). Status der Verfügbarkeit und Anwendung von „next generation sequencing“ (NGS) beim Harnblasenkarzinom – eine Umfrage in der Arbeitsgemeinschaft Uropathologie. Urologe. https://doi.org/10.1007/s00120-019-01046-2
MLA:
Ortiz-Brüchle, N., et al. "Status der Verfügbarkeit und Anwendung von „next generation sequencing“ (NGS) beim Harnblasenkarzinom – eine Umfrage in der Arbeitsgemeinschaft Uropathologie." Urologe (2019).
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